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应用Python处理生物信息数据和作图培训

课程简介

一、准备工作

  1. 1. 为什么是Python?
  2. 2. 为什么不是Python?
  3. 3. Python 2还是Python 3?
  4. 4. 安装Anaconda
  5. 5. 用什么编辑器编写Python程序
  6. 6. 安装Jupyter Notebook
  7. 7. Jupyter Notebook的使用

二、Python语言基础

  1. 1. Python的基本元素:数字、字符串和变量
  2. 2. Python容器:列表、元组、字典与集合
  3. 3. Python的控制结构
  4. 4. Python的模块、包和程序
  5. 5. Python中的类和对象

三、Python基础实战

  1. 1. 十五道精选练习题,助教一对一辅导

四、Python科学计算和机器学习

  1. 1. Python与科学计算:NumPy、SciPy、pandas、statsmodels
  2. 2. Python与机器学习:scikit-learn、TensorFlow和Keras

五、Python绘图

  1. 1. Python绘图:matplotlib、seaborn和Altair

六、Python科学计算与绘图实战


七、结业考试

  1. 1. 成绩优秀的同学可获得优秀证书

主讲教师

主讲老师包括中科院微生物所、遗传发育所、基因组、生物物理所等多名本领域一线技术专家。

陈同,博士,2015毕业于中科院遗传与发育生物学研究所,生物信息专业,在Cell Stem Cell,NAR等高水平杂志以第一作者或主要作者发表文章,运营有数万关注度的《生信宝典》微信公众号。

  1. Chen Tong*, Hao Ya-Juan*, Zhang Ying*, Li Miao-Miao*, Wang Meng, Han Weifang, Wu Yongsheng, Lv Ying, Hao Jie, Wang Libin, Li Ang, Yang Ying, Jin Kang-Xuan, Zhao Xu, Li Yuhuan, Ping Xiao-Li, Lai Wei-Yi, Wu Li-Gang, Jiang Guibin, Wang Hai-Lin, Sang Lisi, Wang Xiu-Jie, Yang Yun-Gui, and Zhou Qi. (2015) m6A RNA methylation is regulated by microRNAs and promotes reprogramming to pluripotency. Cell Stem Cell 16, 289–301 (cover story)

  2. Cui Yi*, Xiao Zhifeng*, Chen Tong*, Wei Jianshu, Chen Lei, Liu Lijun, Chen Bing, Wang Xiujie, Li Xiaoran, and Dai Jianwu. (2014) The miR-7 identified from collagen biomaterial based 3-D cultured cells regulates neural stem cell differentiation. Stem Cells and Development 23, 4: 393-405. (*co-first author)

  3. Wu Hua-Jun*, Ma Ying-Ke*, Chen Tong, Wang Meng and Wang Xiu-Jie. (2012) PsRobot: a web-based plant small RNA meta-analysis toolbox. Nucleic Acids Research 40:W22-W28.


马英克,北大才女,科学院博士,爱荷华博后,任职于中科院基因组所,熟悉二三代测序和网站建设,以第一作者或并列第一作者在NAR、Bioinformatics等发表多篇文章。

Wu Hua-Jun*, Ma Ying-Ke*, Chen Tong, Wang Meng and Wang Xiu-Jie. (2012) PsRobot: a web-based plant small RNA meta-analysis toolbox. Nucleic Acids Research 40:W22-W28.

助教团队

十余名科学院、清华、北大硕士、博士,轮值讲师和助教,辅助学员学习和矫正教授过程中不足的点。

授课模式

  • 本课程以讲解流程和实际操作为主,采用独创四段式教学:
  • 第一阶段 3天集中授课;
  • 第二阶段 自行练习2周;
  • 第三阶段 在线直播答疑;
  • 第四阶段 培训视频继续学习;
  • 实现教-练-答-用四个环节的统一协调。

培训时间

2018-01-20 到 2018-01-22 (线下讲解实战)
每天早9点到晚6点,半封闭式教学(最后1小时为圆桌讨论时间,增加互动交流。最后一天会稍微提前一些,多留出时间讨论,也方便老师乘车返回)
报到时间:提前一天或者当天都可以


授课地点

北京市西城区鼓楼附近 点击查看地铁线路图

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课程价格

1. 4000 元/人(住宿自行解决,提供培训期间午餐)
2. 名额有限,每次课程报名满40人后自动关闭报名通道
3. 提供易汉博基因科技实习机会或工作机会

课程福利

1. 座位按报名并成功缴费顺序从前到后龙摆尾式排序
2. 赠送程序基础课一份
3. 多人 (N,10>N>1) 组团报名并同时缴费,每人还可减免N-1百元 (最高500)报名
4. 赠送金士顿U盘一个(32G含培训数据和脚本)
5. 附推荐语分享对应的招生信息到朋友圈,截图发到train@ehbio.com 可获得200元生信宝典腾讯课堂课程优惠券(可拆分供多个课程使用)

注意事项 *

1. 需自备笔记本电脑。推荐使用win10系统,4G以上内存。如果使用其它操作系统,以培训软件能安装运行为主。
2. 课程实践根据需要会提供云计算平台。
3. 培训班所有数据,文档为内部资料,仅供参阅,未经允许不得翻印外传登刊。
4. 上课期间禁止录音,录像。
5. 成功付款的学员,若临时有紧急事情不能到来的,可申请延期,更换后续培训班;也可申请退款。
6. 若开课2周 (含) 内申请退款可退还85%的课程费用;开课3个工作日 (含) 前申请退款可退还70%的课程费用。
7. 不可先延期再退款。
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